Dans le cadre de la Stratégie Nationale pour la Biodiversité (2011-2020), l’importance d’utiliser des indicateurs fiables pour orienter les actions en faveur de la biodiversité a été soulignée. L’Observatoire National de la Biodiversité joue un rôle central dans le développement d’outils simples et accessibles permettant d’évaluer l’état de la faune et de la flore. Parmi les indicateurs proposés figurent les Listes rouges, qui recensent les espèces menacées, ainsi que des données sur le déplacement des aires de répartition et l’abondance des espèces communes. Ces outils, complétés par d’autres indicateurs spécifiques, aident à guider les efforts de préservation.
Dans ce contexte, la Société Française pour l’Étude et la Protection des Mammifères (SFEPM) a pour objectif de développer et d’animer un Observatoire National des Mammifères Sauvages, incluant un volet spécifiquement dédié aux chauves-souris.

Un enjeu national : protéger les populations de chauves-souris
Les chauves-souris, en tant qu’indicateurs biologiques, jouent un rôle important dans l’évaluation de l’état de conservation de la biodiversité. L’objectif principal de cette action est de suivre :
- L’évolution spatiale et temporelle des populations de chauves-souris
- Les transformations de leurs habitats
- Les pressions et menaces auxquelles elles sont exposées
Ces données permettront de répondre aux besoins d’évaluation à l’échelle nationale et européenne, tout en mesurant l’efficacité du Plan National d’Actions Chiroptères (PNAC).
Une collaboration pour la collecte et la valorisation des données
Afin d’assurer la qualité des analyses, la cohérence dans le recueil des données est primordiale. La SFEPM s’appuie sur le réseau des groupes Chiroptères régionaux et collabore avec des partenaires clés tels que le Muséum National d’Histoire Naturelle (MNHN) et l’Office National des Forêts (ONF). Ces acteurs unissent leurs compétences et leurs connaissances pour :
- Synthétiser les données collectées ;
- Valoriser ces informations auprès des décideurs, chercheurs et acteurs locaux ;
- Prioriser les actions de conservation à l’échelle nationale et régionale.

Mesurer l’impact des actions pour la biodiversité
En plus du suivi des populations, cet observatoire vise à répondre aux demandes spécifiques des institutions nationales et européennes en matière d’expertise et d’évaluation. Il permettra également de mesurer l’impact des actions mises en place dans le cadre du PNA Chiroptères, contribuant ainsi à l’amélioration continue des stratégies de conservation.

Et concrètement ?
Espèce méconnue et migratrice à forts enjeux de conservation, la Grande noctule est une des espèces ciblées comme prioritaires pour cette action. La SFEPM propose un plan d’actions en faveur de cette espèce, permettant de mutualiser les moyens disponibles pour la recherche de gîtes, les analyses génétiques de population, l’étude de la migration ou l’impact du développement éolien. Ces différents outils permettront d’améliorer les connaissances concernant la biologie de cette espèce.
Observatoire – Documents utiles
Rapport d’activité plateforme CACCHI – MNHN – 2024
Le rapport d’activités 2024 de la plateforme CACCHI (Coordination et Animation de la Capture des Chiroptères) détaille ses actions pour harmoniser les pratiques de capture des chauves-souris en France. Structurée en quatre axes, elle assure la formation des chiroptérologues (309 personnes habilitées depuis 2013), la gestion des autorisations de capture à visée scientifique (432 délivrées depuis 2020), l’archivage et la valorisation des données (77 922 individus capturés documentés), ainsi qu’une veille scientifique sur les méthodes et l’éthique. La plateforme facilite la coordination nationale, soutient les projets de recherche et développe des outils, comme la base de données dbChiro-CACCHI, prévue pour 2025.
Rapport d’activité AMI – Surveillance nationale du Minioptère de Schreibers – 2022
En 2019, une synthèse nationale a révélé que les populations de chauves-souris, notamment le Minioptère de Schreibers, sont fragiles, avec un déclin marqué depuis une épizootie en 2002. En réponse, un projet de surveillance nationale a été lancé en 2021, coordonné par la SFEPM et soutenu par l’Office Français de la Biodiversité (OFB), afin de mieux comprendre et suivre l’évolution des populations de cette espèce. Ce projet inclut l’homogénéisation des méthodes de comptage et l’expérimentation d’une nouvelle approche acoustique pour suivre l’occupation des sites. Après une première année de travail en 2022, des données ont été collectées, permettant d’affiner les protocoles de suivi et de renforcer la coopération entre les différents acteurs impliqués.
Chir’eau – Étude de 5 espèces de chauves-souris liées aux zones humides – 2018/2021
Le programme CHIR’Eau, lancé en 2018, est axé sur l’étude des chauves-souris des zones humides du Nord et du Pas-de-Calais, soutenu par la Coordination Mammalogique du Nord de la France et l’Agence de l’Eau Artois-Picardie. Ce projet vise à améliorer les connaissances sur ces espèces, particulièrement celles liées aux milieux aquatiques, dont les populations sont en déclin. Les études précédentes ont révélé un état de conservation préoccupant des chauves-souris des zones humides, et le projet CHIR’Eau se concentre sur des espèces comme le murin des marais, le murin de maubenton, le murin d’Alcathoé, la pipistrelle pygmée et le grand rhinolophe pour mieux comprendre leur biologie, leur écologie, et l’impact des menaces telles que la pollution lumineuse et la dégradation des habitats aquatiques.
Synthèse des connaissances sur le Minioptère de Schreibers – SFEPM – 2021

La synthèse sur le Minioptère de Schreibers révèle qu’en 2021, la population hivernale était de 110 500 individus, avec des tendances fluctuantes entre 1990 et 2020, marquées par une épizootie en 2002 et un pic en 2011 suivi d’une chute en 2012. Sur 21 sites majeurs, 5 affichent une tendance positive, tandis que 12 montrent un déclin et 3 restent stables. Cette analyse souligne l’importance des contributions des observateurs et des structures régionales pour comprendre l’évolution des populations de cette espèce.
Deux nouvelles espèces cryptiques de chauves-souris au sein du complexe d’espèces Myotis nattereri (Vespertilionidae, Chiroptera) de l’Ouest paléarctique – 2019
Le document présente une étude sur deux nouvelles espèces cryptiques de chauves-souris du complexe Myotis nattereri, en utilisant des analyses morphologiques et génétiques. Publié dans BioOne Complete, il souligne l’importance de la diversité cryptique dans la conservation des espèces, en identifiant quatre lignées distinctes, dont deux nouvelles espèces, Myotis crypticus et Myotis zenatius. L’étude appelle à une réévaluation du statut de conservation de ces espèces en raison de leur diversité non reconnue jusqu’à présent.
Observatoire National des Mammifères – Volet Chiroptère – État de l’art – Septembre 2018
L’Observatoire National des Mammifères – Volet Chiroptère a pour mission d’évaluer et d’informer sur l’état et l’évolution des populations de chiroptères en France métropolitaine, en s’appuyant sur une base de données agrégée provenant de diverses structures participantes. Ce projet, initié lors de la Coordination Chiroptères Nationale en 2016, vise à standardiser la collecte de données et à produire des référentiels méthodologiques pour assurer la cohérence et la conformité des informations. En outre, il met en lumière les menaces pesant sur ces espèces et permet de suivre les tendances de leurs populations, tout en facilitant la communication et l’intégration des chiroptères dans les politiques publiques.
Observatoire national des Chiroptères : contexte, enjeux et existant – 2018
L’Observatoire national des Chiroptères, un projet coordonné par la SFEPM visant à améliorer la conservation des chauves-souris en France. Cet observatoire a pour objectifs de mutualiser les connaissances, harmoniser les méthodologies, suivre les populations et leur habitat, et répondre aux besoins des politiques publiques nationales et européennes. Le projet repose sur un réseau collaboratif entre acteurs régionaux et nationaux, notamment le MNHN, et s’appuie sur des programmes tels que Vigie-Chiro pour collecter des données standardisées. Il s’intéresse à des problématiques comme l’état des espèces, les menaces (éoliennes, infrastructures) et la mise en place d’indicateurs pour suivre les tendances.
Catalogue descriptif des études par radiopistage sur les Chiroptères en France métropolitaine – juin 2017
Ce projet vise à centraliser et diffuser les connaissances issues des études par radiopistage menées en France entre 1997 et 2016. Coordonné par la SFEPM dans le cadre du Plan National d’Actions Chiroptères, ce projet a permis de cataloguer 847 études, dont 446 accompagnées de rapports détaillés, et de rassembler 339 sessions de télémétrie. Ces sessions sont axées sur l’utilisation du radiopistage pour analyser l’écologie, les déplacements et les habitats des chauves-souris. Ce travail, mené dans le cadre du PNA Chiroptères, standardise les protocoles, identifie les lacunes géographiques et écologiques, et propose des outils pour optimiser le suivi télémétrique. Il constitue une ressource essentielle pour structurer, diffuser et valoriser les connaissances issues de cette méthode.
Guide technique – Techniques d’imagerie au service de la conservation – 2014
Une exploration des techniques d’imagerie avancées utilisées pour la conservation des chauves-souris, en particulier le Grand Rhinolophe et le Murin à oreilles échancrées. Grâce aux progrès technologiques, les caméras thermiques et les dispositifs de vidéo numérique permettent désormais d’observer ces animaux nocturnes avec une meilleure précision. Les caméras thermiques détectent la chaleur, mais leur efficacité dépend de la différence de température entre les chauves-souris et leur environnement, ce qui peut poser des défis, notamment lors de l’hibernation. De plus, les caméras de photo-surveillance présentent des limitations en termes de sensibilité et de rapidité, rendant difficile la capture d’images exploitables des chauves-souris en vol. Pour surmonter ces obstacles, des appareils photographiques numériques ont été modifiés pour être sensibles aux infrarouges, permettant des observations à distance.
Guide technique – Conduite de prospections hivernales en cavités – 2014
Le Guide Technique n°4 – LIFE+ Chiro Med (2010-2014) se concentre sur la conservation et la gestion des populations de chauves-souris, notamment le Grand Rhinolophe et le Murin à oreilles échancrées, en région méditerranéenne française. Le programme a mis en place des prospections hivernales pour évaluer et protéger les sites d’hibernation des chauves-souris, en utilisant des techniques de suivi telles que les visites de grottes et l’installation d’enregistreurs automatiques d’ultrasons (AnaBatTM) pour monitorer les espèces. Les résultats ont permis d’identifier les principaux gîtes d’hibernation, de réaliser un suivi des populations, et de définir des mesures de protection adaptées. Ces actions ont contribué à la préservation des habitats spécifiques et au maintien de la biodiversité des chiroptères dans cette zone méditerranéenne.
Guide méthodologique de hiérarchisation des sites protégés et à protéger à Chiroptères -2013

Méthode pour évaluer l’importance des gîtes de chauves-souris en France, en fonction de leur rôle biologique (reproduction, hibernation, transit) et de leur population. La hiérarchisation repose sur un calcul combinant la sensibilité des espèces, leur responsabilité régionale et l’importance des colonies, pondérée par le type de gîte. Les sites sont classés en trois niveaux d’intérêt (international, national, régional) pour orienter leur gestion et protection. Le guide aborde aussi des cas spécifiques, comme les sites de swarming, et propose des outils automatisés pour standardiser les évaluations.
Ailleurs sur le web
Comprendre et déterminer les clefs de la conservation du Murin de Daubenton, une chauve-souris menacée en Bretagne.